在洛克人打败威利博士之后,威利博士为了教育威利博士而叫来了莱西,并且使用莱西视讯放映了过去威利博士每次被打败后跪地求饶的录像。为了能够逃走,威利博士决定利用自己在录制假造视频时制作的机器莱特博士**洛克人上当,最后洛克人和假莱特博士都被笼子放出的高压电击倒,而威利博士则趁机逃出了威利城堡并且启动了自毁系统试图消灭洛克人。
然而洛克人在哥萨克博士的帮助下很快就打败了威利机器人们,并且在攻入暗黑城后找到了暗黑人。尽管威利博士制作的暗黑人Ⅳ在一开始依靠着强大攻击力重创了洛克人,但是真正的布鲁斯却在危急关头忽然出现并且帮助洛克人打败了暗黑人Ⅳ,最后威利博士不得已在暗黑人系列全灭之后亲自出手对付洛克人。但是威利博士虽然连续使用威利压缩机以及威利**等兵器袭击了洛克人,但还是难逃被洛克人打败的命运。在被洛克人打败之后威利博士立刻就试图逃走,结果却不小心跑到了**莱特博士的房间。就在这时威利城堡的自毁系统忽然启动,而威利博士则趁着洛克人支撑坍塌的城堡之际逃出了城堡并且扬长而去。
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