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生物质谱也是根据离子的质量、质荷比来确定待测分子的分子量，但生物大分子比较脆弱，在拆分和电离成团的生物大分子过程中它们的结构和成分很容易被破坏，生物质谱则采用软电离技术以完整地保存生物大分子的结构，电离后主要获得分子离子，从而能有效检测出生物样品的分子量。目前应用最广泛的软电离方式为电喷雾电离技术和基质辅助激光解析电离技术。接下来我们详细介绍两种软电离技术：

电离辐射可以从原子、分子或其他束缚状态放出一个或几个电子，非电离辐射则不行。电离能力决定于射线携带的能量，而不是射线的数量。如果射线没有带有足够电离能量的话，大量射线并不能导致受作用物的电离。

在外加能量作用下，如进行**、加外电场、激光照射等时，气体分子或原子会发生电离，形成带负电荷的电子和带正电荷的离子。由离子、电子、**基、激发态的分子和原子所组成的电离气体，处于激发、电离的高能状态，其电子的负电荷和离子的正电荷总数相等，宏观上对外不显电性，呈中性，称为等离子体。

基质辅助激光解吸电离（MALDI）是一种软电离方法，其“基质”由要检测的分子类型决定，将基质过量添加到要分析的样品中用激光照射使分析物分子气化从而产生带正电和带负电离子。

低温等离子体中离子、电子、**基、激发态的分子和原子所组成的电离气体，处于激发、电离的高能状态易于和所接触的物质发生反应，因此，低温等离子体被广泛应用于灭菌消毒、空气净化和工业尾气处理中。