与此同时,莱特博士认定这次的事件又是威利博士在背后操纵,并且派出了洛克人出发前往各个被破坏的城市击退机器人军团,并且寻找妨害电波的来源。在机器人军团都被打倒之后,洛克人根据线索来到了威利城,并且打倒了威利博士派出的庞克。而威利博士则在庞克被打败之后召唤出了海底的威利基地,同时驾驶着新的威利机器向洛克人发起了攻势。在被洛克人打败之后,威利博士立刻就驾驶着逃生舱逃出了即将沉入海底的威利基地,但是逃生舱刚飞出基地没多久就忽然出了故障,最后直接掉进了海里。
随后洛克人在一番苦战之后终于打败了庞克,但是威利博士已经舍弃威利城并且逃向了威利基地。为了彻底消除妨害电波,洛克人再度侵入威利基地并且打败了威利机器。而计划失败的威利博士虽然驾驶着幽浮逃出了基地,但是没飞多远幽浮就忽然出了故障并且掉进了海里。
在威利机器人团灭之后,威利博士派出了昆特试图除掉洛克人。但是洛克人却打倒了昆特,没有办法威利博士只能立刻弃城而逃并且来到了威利基地,并且驾驶着自己花费了大量成本制作的威利机器袭击了洛克人。然而威利博士耗费精力制作的威利机器还是没能打倒洛克人,没有办法威利博士只能开着驾驶舱立刻逃出了威利基地。可是洛克人却复制了威利机器的追踪飞弹,并且使用追踪飞弹击坠了威利博士的驾驶舱。
一名20多岁的韩国女子从美军基地正门逃出,大喊“我被性侵了,救命啊!”军务员发现后,将该女子移交美军宪兵队。嫌犯隶属美军第8战斗飞行团,是一名现役美军官兵,具体军衔和年龄未予公布。他自称是和受害女子协商好之后发生性关系,否认性侵指控。
一名20多岁的韩国女子从美军基地正门逃出,大喊“我被性侵了,救命啊!”军务员发现后,将该女子移交美军宪兵队。