然而洛克人在哥萨克博士的帮助下很快就打败了威利机器人们,并且在攻入暗黑城后找到了暗黑人。尽管威利博士制作的暗黑人Ⅳ在一开始依靠着强大攻击力重创了洛克人,但是真正的布鲁斯却在危急关头忽然出现并且帮助洛克人打败了暗黑人Ⅳ,最后威利博士不得已在暗黑人系列全灭之后亲自出手对付洛克人。但是威利博士虽然连续使用威利压缩机以及威利战机等兵器袭击了洛克人,但还是难逃被洛克人打败的命运。在被洛克人打败之后威利博士立刻就试图逃走,结果却不小心跑到了**莱特博士的房间。就在这时威利城堡的自毁系统忽然启动,而威利博士则趁着洛克人支撑坍塌的城堡之际逃出了城堡并且扬长而去。
为了救出莱特博士,洛克人再度入侵了威利城堡,并且在打败威利博士之后找到了莱特博士。然而,威利城堡却忽然开始崩塌,洛克人虽然顶住了坠落的天花板但也因此而动弹不得。就在这时,天花板忽然仿佛被支撑住一般不再坍塌,洛克人与莱特博士则趁机逃出了城堡。
为了阻止威利博士的野心,洛克人在卡琳卡的协助下很快就入侵到了威利城的**,并且在密道尽头再度打败了威利博士。但威利博士却在跪地求饶时启动暗门逃走并启动了城堡的自毁系统,最终洛克人只能立刻逃出威利城堡。在离开威利城后,洛克人发现威利博士已经驾驶飞行器逃到远方,最终洛克人只能就这么回到莱特研究所。
警方开始调查这件案件,但进入城堡后却遇到了很多阻碍。城堡内的灯光不断闪烁,突然灭掉,整个城堡陷入黑暗。警方开始感到不寒而栗,他们发现城堡里仿佛有幽灵的存在。他们遇到了种种诡异的事情,似乎被幽灵追逐着。一些奇怪的符号和线索表明,约翰并不是这个城堡的唯一受害者。
警方和作家遭遇了很多诡异的事情,他们感到有一种不知名的力量在阻碍他们前进。他们感到一种难以言喻的恐惧和压力,仿佛在城堡内有着**的存在。他们继续搜寻城堡,但逐渐被幽灵般的存在包围。